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Wonder Waffel wurde 2011 von drei jungen Studenten in Berlin gegründet. Obwohl sich das Produkt wirtschaftlich nicht rentierte, bestand trotzdem eine hohe Nachfrage, wie die Gründer im Interview für den Preis des Jung-Unternehmers 2014 erklärten. Am 3. März 2012 eröffneten die Gründer den ersten Wonder Waffel Store. Nach der ersten Filialeröffnung 2012 machte Wonder Waffel gute Umsätze. Innerhalb der nächsten drei Jahre generierte Wonder Waffel genug Kapital um weitere vier Geschäfte in Berlin zu eröffnen, die nach demselben Prinzip der Cooperate Identity aufgebaut wurden um späteren Franchise-Plänen angepasst zu sein. Die Shop Eröffnung in Basel fand 20. Februar 2019 statt.
